Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC93Q567U6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC93Q567U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC93Q567U6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC93Q567U6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms