Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1BQ53T94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1BQ53T94 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1BQ53T94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms