Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN52Q52LA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN52Q52LA3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms