Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd28Q505D1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd28Q505D1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd28Q505D1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.2 ms