Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC1Q4ZHG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FNDC1Q4ZHG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC1Q4ZHG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNDC1Q4ZHG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms