Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KHDC1Q4VXA5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KHDC1Q4VXA5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KHDC1Q4VXA5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KHDC1Q4VXA5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms