Protein–RNA interactions for Protein: Q4PLS0

Nlrp2, NACHT, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp2Q4PLS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp2Q4PLS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp2Q4PLS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp2Q4PLS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp2Q4PLS0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp2Q4PLS0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms