Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Prpf38aQ4FK66 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prpf38aQ4FK66 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prpf38aQ4FK66 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf38aQ4FK66 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms