Protein–RNA interactions for Protein: Q497N6

Cep295nl, CEP295 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep295nlQ497N6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep295nlQ497N6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep295nlQ497N6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep295nlQ497N6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep295nlQ497N6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep295nlQ497N6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms