Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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BC100530Q497J0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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BC100530Q497J0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BC100530Q497J0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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BC100530Q497J0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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BC100530Q497J0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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BC100530Q497J0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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BC100530Q497J0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BC100530Q497J0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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BC100530Q497J0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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BC100530Q497J0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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BC100530Q497J0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BC100530Q497J0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BC100530Q497J0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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