Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC36A3Q495N2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A3Q495N2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A3Q495N2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms