Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM176BQ3YBM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM176BQ3YBM2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM176BQ3YBM2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM176BQ3YBM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM176BQ3YBM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms