Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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