Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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