Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldlrad2Q3V0V0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ldlrad2Q3V0V0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldlrad2Q3V0V0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms