Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
4930567H17RikQ3V0K5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930567H17RikQ3V0K5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930567H17RikQ3V0K5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
4930567H17RikQ3V0K5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930567H17RikQ3V0K5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms