Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc27Q3V036 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc27Q3V036 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc27Q3V036 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms