Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm6Q3UZD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm6Q3UZD5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm6Q3UZD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm6Q3UZD5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms