Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5aQ3UXZ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Kdm5aQ3UXZ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5aQ3UXZ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5aQ3UXZ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5aQ3UXZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5aQ3UXZ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5aQ3UXZ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5aQ3UXZ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms