Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim15Q3UTD9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim15Q3UTD9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim15Q3UTD9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms