Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubtfl1Q3USZ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubtfl1Q3USZ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubtfl1Q3USZ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms