Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf48Q3US17 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf48Q3US17 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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