Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm20Q3UQS8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm20Q3UQS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbm20Q3UQS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbm20Q3UQS8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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