Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smcr8Q3UMB5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smcr8Q3UMB5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smcr8Q3UMB5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smcr8Q3UMB5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smcr8Q3UMB5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms