Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc33Q3ULW6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc33Q3ULW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc33Q3ULW6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc33Q3ULW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms