Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mccc2Q3ULD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mccc2Q3ULD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms