Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cmpk2Q3U5Q7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmpk2Q3U5Q7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmpk2Q3U5Q7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmpk2Q3U5Q7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmpk2Q3U5Q7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmpk2Q3U5Q7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmpk2Q3U5Q7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmpk2Q3U5Q7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmpk2Q3U5Q7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms