Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tatdn3Q3U1C6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tatdn3Q3U1C6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tatdn3Q3U1C6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms