Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tespa1Q3U132 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tespa1Q3U132 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tespa1Q3U132 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tespa1Q3U132 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms