Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraddQ3U0V2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraddQ3U0V2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TraddQ3U0V2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TraddQ3U0V2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms