Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trappc9Q3U0M1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc9Q3U0M1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc9Q3U0M1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc9Q3U0M1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms