Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc28Q3TX51 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc28Q3TX51 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc28Q3TX51 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc28Q3TX51 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms