Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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