Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh5Q3TSG4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh5Q3TSG4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh5Q3TSG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh5Q3TSG4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alkbh5Q3TSG4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh5Q3TSG4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh5Q3TSG4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms