Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
XylbQ3TNA1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XylbQ3TNA1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XylbQ3TNA1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XylbQ3TNA1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms