Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms