Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxi2Q3I5G5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxi2Q3I5G5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxi2Q3I5G5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxi2Q3I5G5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms