Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NBPF8Q3BBV2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NBPF8Q3BBV2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NBPF8Q3BBV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NBPF8Q3BBV2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms