Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox4dQ2MDG0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox4dQ2MDG0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox4dQ2MDG0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox4dQ2MDG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms