Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q1T7F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q1T7F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q1T7F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q1T7F1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q1T7F1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q1T7F1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q1T7F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q1T7F1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q1T7F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q1T7F1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q1T7F1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q1T7F1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q1T7F1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q1T7F1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q1T7F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q1T7F1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q1T7F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q1T7F1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q1T7F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q1T7F1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q1T7F1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q1T7F1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q1T7F1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q1T7F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q1T7F1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q1T7F1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q1T7F1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q1T7F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q1T7F1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q1T7F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q1T7F1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q1T7F1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q1T7F1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q1T7F1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q1T7F1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q1T7F1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q1T7F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q1T7F1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q1T7F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q1T7F1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q1T7F1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q1T7F1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q1T7F1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q1T7F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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