Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RTL8BQ17RB0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RTL8BQ17RB0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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