Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMA3Q16787 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMA3Q16787 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA3Q16787 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA3Q16787 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA3Q16787 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
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