Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPPQ16740 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPPQ16740 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLPPQ16740 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPPQ16740 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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