Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF239Q16600 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF239Q16600 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF239Q16600 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF239Q16600 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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