Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIK5Q16478 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIK5Q16478 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRIK5Q16478 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRIK5Q16478 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
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