Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2Q16342 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2Q16342 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCD2Q16342 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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