Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
E2F4Q16254 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
E2F4Q16254 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E2F4Q16254 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F4Q16254 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E2F4Q16254 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
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