Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF56Q15929 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF56Q15929 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF56Q15929 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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