Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MSMO1Q15800 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSMO1Q15800 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MSMO1Q15800 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSMO1Q15800 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms