Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SYCP1Q15431 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP1Q15431 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP1Q15431 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP1Q15431 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP1Q15431 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP1Q15431 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP1Q15431 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP1Q15431 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP1Q15431 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP1Q15431 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP1Q15431 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP1Q15431 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP1Q15431 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP1Q15431 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP1Q15431 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP1Q15431 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYCP1Q15431 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP1Q15431 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP1Q15431 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP1Q15431 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP1Q15431 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP1Q15431 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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